多功能气相色谱仪是以气体作为流动相，当样品由微量注射器“注射”进入进样器后，被载气携带进入填充柱或毛细管色谱柱。由于样品中各组分在色谱柱中的流动相和固定相间分配或吸附系数的差异，在载气的冲洗下，各组分在两相间作反复多次分配使各组分在柱中得到分离，然后用接在柱后的检测器根据组分的物理化学特性将各组分按顺序检测出来。多功能气相色谱仪就是首先确定样品预处理方法，然后优化分离条件，直至达到满意的分离结果。最后，建立数据处理方法，包括：定性鉴定和定量鉴定。方法的一般步骤如下：
1、样品来源及其预处理方法：
GC能直接分析的样品必须是气体或液体，固体样品在分析前应当溶解在适当的溶剂中，而且还要保证样品中不含GC不能分析的组分（如，无机盐）或可能会损坏色谱柱的组分。
2、确定仪器配置：
所谓仪器配制就是用于分析样品的方法所采用的进样装置、载气、色谱柱以及检测器。
3、确定初始操作条件：
当样品准备好，且仪器配制确定之后，就可开始进行尝试性分离。
进样量要根据样品浓度、色谱柱容量、检测器灵敏度来确定。色谱柱温度的确定主要由样品的复杂程度和气化温度决定。
检测器的温度是指检测器加热块温度，而不是实际监测点（如，火焰）的温度。
